九校联盟（C9）是中国首个顶尖大学间的高校联盟，于2009年10月启动。联盟成员都是国家首批985重点建设的9所一流大学，包括北京大学、清华大学、复旦大学、上海交通大学、南京大学、浙江大学、中国科学技术大学、哈尔滨工业大学、西安交通大学共9所高校。
2014年11月7日，中国科学院大学（简称国科大）正式参与C9联盟活动。
根据签订的《一流大学人才培养合作与交流协议书》，“九校联盟”将不断加强深层次合作与交流，充分利用优质办学资源，优势互补，发挥人才培养中的示范与引领作用。其主要内容有：
①实施本科生交流和研究生联合培养。
②联合举办系列暑期学校，打造国际知名的“C9”教育品牌。
③联合开展教材建设，教学与教改研究；联合建立和发布以精品课程为骨干的学分互认课程目录；联合建立共享的远程教育平台，进行远程学习。
④建立人才培养对口部门定期交流机制，进行相互间交流、学习和借鉴。
每年分招生、培养、学位和学籍与培养机制改革4个模块各召开一次研究生院业务交流研讨会，并召开一次本科教务管理部门的主要负责人会议，由9校相关部门轮流举办。
⑤联合开展青年教师教学能力和青年导师队伍培训工作。
⑥设立9校合作联盟专门网站，建立9校间博士学位论文网上相互评审系统，共同提高博士研究生的培养质量。
⑦联合举办以同专业本科生为主参加的联合野外考察、联合生产实习、联合设计实习、联合社会调查等各种专业实践和社会实践活动。
⑧积极推动研究生培养机制改革，引领中国高水平研究生培养同世界一流大学接轨。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：建筑、土木工程、机械工程、力学、计算机科学与技术、电子信息、核科学与技术、协和医科（合作办学），物理学、生物学、光学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、控制科学与工程、水利工程、化学工程与技术、环境科学与工程、管理科学与工程。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：哲学、经济管理、数学、物理，文学、历史学、医学、经济学、法学、管理学、化学、天文学、地理学、大气科学、生物学、图书馆情报与档案学。
物理学、化学、考古学、数学、药学、哲学、外国语言文学、中国语言文学等全部排名全国第一，经济学、法学、医学、心理学等排名全国第二。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：政治学、中国语言文学、新闻传播学、中国史、数学、生态学、基础医学、临床医学、中西医结合、哲学、应用经济学、物理学、化学、生物学、公共卫生与预防医学等15个。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：机械工程、船舶与海洋工程、临床医学、生物医学工程、口腔医学、生物学、科学技术史、动力工程及工程热物理、信息与通信工程、基础医学、管理科学与工程等11个。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：光学工程、农林经济管理、光学工程、农林经济管理、生态学、农业工程、园艺学、农业资源与环境、植物保护、管理科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、软件工程、畜牧学等14个。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：物理学、地球物理学、天文学、科学技术史、核科学与技术、安全科学与工程等6个。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：物理学、天文学、地质学、外国语言文学、化学、大气科学、图书情报与档案管理、政治学、社会学、中国语言文学、世界史、生态学等12个。其中，地质学、天文学、物理学排名全国第一。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：工商管理、动力工程及工程热物理、电气工程、管理科学与工程、机械工程等5个。
最新全国高校学科评估前三甲的学科专业有：力学、土木工程、环境科学与工程、材料科学与工程、控制科学与工程等5个。
2014年首招本科生，专业仅有：数学与应用数学、物理学、化学、生物科学、材料科学与工程、计算机科学与技术等6个。